故事发生在近未来世界，一种名为“HUGE”的神秘生命体突然降临地球，将人类的命运推向了濒临灭绝的边缘。面对生死存亡的危机，世界各国携手研发出能够与之抗衡的决战兵器“CHARM””，而唯有少女们才能驾驭这些武器，她们被尊称为“莉莉（Lily）”，成为了守护世界的最后防线。 为了培养与支援莉莉们，世界各地纷纷建立起专门的教育机构“Garden”。我们的女主角一柳梨璃（配音：赤尾光）以某件事为契机，立志成为莉莉，并替补合格入读了被誉为名门的百合丘女学院。她性格和善，拥有让人不知不觉产生好感的天然魅力，秉持着“不怕失败去挑战就能成功”的信念，却时常因过度努力而冲过头。 在百合丘女学院，梨璃邂逅了一群个性鲜明、并肩作战的同伴：待人冷淡却实力顶尖、因过往事件而与人保持距离的白井梦结（配音：夏吉优子）；在 external 入学考试中拔得头筹、出身富贵且厌恶卑劣手段的千金大小姐枫·J·努韦尔（配音：井泽美香子）；以及拥有超高智商、知识面极广的“莉莉宅”二川二水（配音：西本里美）。她们组成了一柳队，为执行任务前往东京。 以此为契机，命运的齿轮开始转动。鲁德比克女学院、爱伦斯基女学园、神庭女子艺术高校、御台场女学校、相模女子高等学馆，以及百合丘女学院的少女们，她们的命运开始在战火中交错，共同谱写出一段属于莉莉们的青春与战斗物语。