天才魔术高中生黑羽快斗，偶然在自己房间内一道隐藏的门后发现了密室，里面竟存放着世界闻名的大盗——怪盗基德的专属服装。身着基德服装的快斗，意外遇见了父亲（世界知名魔术家黑羽盗一）生前的助手寺井黄之助。从寺井口中，快斗得知了一个震惊的真相：自己的父亲正是初代怪盗基德，且并非死于意外，而是惨遭暗杀。为了追查杀害父亲的真凶，快斗决定继承父亲的身份，以第二代怪盗基德的姿态展开秘密调查。在某次以怪盗基德身份活动时，快斗与一个称呼其为“黑羽盗一”的神秘组织狭路相逢。而这个隐藏在暗处的组织，正是他的杀父仇人……一场交织着魔术、悬疑与复仇的华丽对决，就此正式拉开帷幕。
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