TNT续订《末日孤舰》第三季，这部由迈克尔·贝担任执行制片人的硬核科幻惊悚剧集，凭借其扣人心弦的剧情与火爆的动作场面，在TNT电视网始终保持着极为出色的收视成绩，此次毫无悬念地获得了13集的续订。近未来某年，地球爆发了一场毁灭性的致命病毒，导致全球过半人口惨遭抹杀。一望无际的茫茫大洋似乎成为了病毒无法涉足的最后神域，而由汤姆·钱德勒船长（埃里克·迪恩 饰）统领的阿利·伯克级导弹驱逐舰“内森-詹姆斯”号，俨然成为了天罚过后漫无目的漂流、等待最终赦免的诺亚方舟。为了保存人类的有生力量，同时确保船上的两名滤过性病原体学者能够顺利研制出抗毒解药，钱德勒船长不惜违抗美国临时政府的召唤，带领全体船员踏上了一条漫漫征途。然而，归途与拯救之路可谓步步杀机。为了获取必要的补给与疫苗原料，他们不得不一次次停靠荒废的港口与危机四伏的陆地，不仅有他国武装舰艇试图野蛮抢夺解药，更有绝望与恐慌的情绪在船员之间悄然蔓延。在这场看不见未来的末世旅程中，何日才是尽头？进入第三季，全新的凶险挑战接踵而至。“内森-詹姆斯”号陷入了致命的鱼雷包围圈，残暴的海盗头领建速在公开视频中展示了被俘的船员，并以此要挟美国总统必须下令让停泊在冲绳的两艘军舰调头离开，否则将在36小时内继续处决人质。钱德勒等人在舰上反复研究人质视频时敏锐地发现，迈克舰长口中所说的编号并非真实编号，而是暗藏玄机的经纬度坐标。与此同时，在偏远的海盗山寨里，以建速为首的海盗对试图逃跑的船员进行着严酷的拷打。被关押的迈克等人并未放弃，决定再次冒险潜入此前发现的信号塔制造动静，以引导钱德勒舰队定位。在寻找传输信号的金属工具时，迈克意外发现了一根被铜丝缠绕的金属棒。面对建速的压迫与谎言，迈克更惊觉所谓的美国治愈药背后隐藏着更深的阴谋。另一边，内森-詹姆斯号派出的无人机在弗港补给站竟侦察到了两艘中国军舰，钱德勒等人深知这必是彭总统的暗中布局。为破此局，钱德勒果断决定趁深夜潜入香港彭的住所，一场跨越海陆的极限营救与政治博弈就此全面爆发。