研究所新人剑崎一真跟随前辈橘朔也封印出逃的 Undead，不久神秘青年相川始频繁出现，时而与骑士对敌、时而暗中出手救人，剑崎始终不愿将他视作纯粹怪物。随着剧情推进层层揭开真相：相川始是毁灭世界的 Joker；BOARD 理事长天王路博史暗中操纵一切，利用不死兽力量制造人造怪物、妄图掌控世界，研究所内部彻底崩塌，四位骑士失去官方支援，独自对抗不死兽与幕后黑手。随着一只只高阶 Undead 被封印，常规 52 只不死兽仅剩最后数只，世界毁灭的倒计时来临。所有人面临终极抉择：必须封印唯一剩余的 Joker 相川始，才能阻止末日，可剑崎早已和始建立无法割舍的友情，不愿亲手消灭自己唯一的朋友。最终决战，所有普通 Undead 全部封印，世界毁灭的预兆降临。剑崎做出颠覆宿命的选择：持续透支帝王形态力量，主动让自己完全异化，成为第二只 Joker。场上存在两只 Joker，极限之战判定双方平局，世界毁灭的规则失效，危机解除。代价是两只 Joker 天生拥有厮杀本能，永远不能相见。结局剑崎独自远走他乡、彻底脱离人类社会，让相川始得以留在人间，以普通人的身份安稳生活，二人终生再未重逢，留下无尽遗憾。