《神秘人质》故事发生在1948年春的解放战争时期。我党高级特工燕文川（刘小锋 饰）身负秘密任务，搭乘火车赶赴老家江城。岂料刚刚抵达，一场突如其来的劫难便将他卷入国共两党秘密斗争的漩涡中心。由于燕文川直属中共上层领导，江城地下党组织对他的真实身份一无所知，将其暂时扣押后，交由刚从苏联留学归来、性格冲动的年轻女干部窦婉茹（黄曼 饰）处理。窦婉茹假扮保姆潜入燕家，密切监视着他的一举一动。然而，老牌特工燕文川怎能看不出其中的端倪？他以不变应万变，冷静应对；而性格莽撞的婉茹却常常自露马脚，两人就此展开了一场充满险情与欢乐的“浪漫满屋”式斗智斗勇。与此同时，江城军统站长陈恭如（宁晓志 饰）对燕文川的才干十分赏识，在娄海平（任柯诺 饰）的引荐下，强行将其招入麾下。从此，燕文川不得不一面与保密局的特工高手们周旋，一面跟完全不了解内情、对自己充满厌恶反感的革命同志窦婉茹巧妙应对。在敌我难辨的生死线上，他隐藏身份伪装成小资产阶级，开始了一场神秘而惊心动魄的周旋，最终顺利完成了艰巨的革命任务。