《汪汪队立大功大电影3：勇闯恐龙岛》从莱德收到一封来自恐龙岛研究站的求救信开始，信上说岛上的恐龙蛋突然集体失踪，毛毛、小砾、阿奇、灰灰、路马、天天、珠珠和贝贝立刻集合，准备出发，可他们刚登上飞机就遇到奇怪气流，被迫降在一片长满巨型蕨类的海岸。剧中主角有莱德、毛毛、小砾、阿奇、灰灰、路马、天天、珠珠、贝贝。莱德发现岛上的导航系统被人篡改，阿奇追踪脚印时找到一只受惊的小恐龙，小砾用工程车推开堵住山洞的巨石，灰灰从废铁堆里拼出一台简易雷达。毛毛忙着照顾小恐龙，路马潜入水下寻找失踪的蛋，天天在空中侦察，珠珠在雪线附近发现可疑车辆，贝贝在丛林里找到一串不属于研究站的轮胎印。剧情很快从寻找恐龙蛋变成阻止偷猎计划，原来有一群盗猎者想利用恐龙岛的特殊磁场孵化并贩卖恐龙，他们切断了研究站与外界的联系，还伪装成救援队。莱德没有贸然行动，他让阿奇和天天先标记盗猎者营地，小砾和灰灰修好一座旧吊桥，毛毛和贝贝负责引开守卫，路马从水下拖走他们的快艇，珠珠在关键路口堆起雪墙。中段最惊险的一幕是火山突然震动，恐龙蛋被卡在岩缝里，莱德带着队伍一边躲避滚石，一边搭起救援通道，阿奇用绳索固定小恐龙，毛毛把医疗包绑在背上，小砾用铲斗顶住岩壁，灰灰用回收零件启动传送带，路马和天天从两侧接应，珠珠和贝贝护送其他小恐龙撤离。盗猎者发现计划失败后想炸毁洞穴，莱德没有硬拼，而是用扩音器播放恐龙叫声，让整个岛上的恐龙一起回应，盗猎者被吓得四散奔逃。这一刻《汪汪队立大功大电影3：勇闯恐龙岛》不再只是寻找失踪的蛋，而是让每个伙伴都发挥长处。高潮发生在火山口边缘，莱德和伙伴们把恐龙蛋送回巢穴，小恐龙们围着他们又叫又跳，研究站终于恢复通讯，警方赶来带走盗猎者。可就在大家以为任务结束时，贝贝发现一只小恐龙被磁场困在旧灯塔，莱德带阿奇和天天赶去，灰灰临时改装灯塔线路，小砾和路马在下方铺开救生网，毛毛照顾受伤的小恐龙，珠珠用雪橇运送药箱，贝贝引开盘旋的翼龙，最终小恐龙回到族群。最后，《汪汪队立大功大电影3：勇闯恐龙岛》让莱德明白，勇气不是不害怕，而是害怕时仍然去帮助别人，毛毛、小砾、阿奇、灰灰、路马、天天、珠珠、贝贝也各自发挥长处，把一场危机变成一次热闹又温暖的冒险。恐龙岛重新亮起灯火，恐龙蛋在月光下安静呼吸，这部作品用欢快节奏和团队合作，讲出一群小英雄如何在远古岛屿上守住生命与友谊。