刘建明（刘德华）在陈永仁（梁朝伟）殉职10个月后，深陷警队内部调查的泥潭。不仅职权被彻底架空，加之家庭变故的沉重打击，他的精神状态每况愈下，走向崩溃边缘，但他依然偏执地坚信局面很快就会扭转。年轻警司杨锦荣（黎明）在同事眼中是个不折不扣的怪人，但他正凭借过人的业绩步步高升，直指警队最高层。为了弄清杨锦荣的真实身份，刘建明悄然展开调查。随着调查的深入，刘建明渐渐发现韩琛旧日的生意拍档沈澄（陈道明）与杨锦荣之间有着千丝万缕的暗中勾连。为了置杨锦荣于死地，更为了掩盖自己真实的黑警身份，渴望“做个好人”已久的刘建明开始千辛万苦地找寻一个又一个证据。然而，在接近陈永仁心理医生以探寻其过往的过程中，刘建明深受内心罪恶感的反噬，逐渐人格分裂出陈永仁的影子。在正邪交织的无间炼狱中，他拼命想要抓住救赎的稻草，却总在最接近真相时功亏一篑，最终走向了无法挽回的终极无间。
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